Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms