Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECW1Q76N89 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms