Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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