Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FSCN1Q16658 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms