Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
R3HDM1Q15032 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms