Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRQ13535 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ATRQ13535 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ATRQ13535 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms