Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vps8Q0P5W1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vps8Q0P5W1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms