Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TRAF3IP3-201ENST00000367023 1065 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZEB2P1-202ENST00000572816 902 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TNP2Q05952 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms