Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMAD3P84022 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMAD3P84022 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms