Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms