Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVPABLB-1P60509 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms