Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXD8P13378 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD8P13378 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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