Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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