Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD6O43541 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD6O43541 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms