Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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LINC00587B1AMM8 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LINC00587B1AMM8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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