Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms