Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AGAP1Q9UPQ3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms