Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC17A6Q9P2U8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC17A6Q9P2U8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1400 ms