Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms