Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCAF1Q9H7N4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAF1Q9H7N4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms