Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BBS2Q9BXC9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms