Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ECSITQ9BQ95 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms