Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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SNX20Q7Z614 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX20Q7Z614 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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