Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms