Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP28Q4G0W2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms