Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
KRTAP13-4Q3LI77 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP13-4Q3LI77 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms