Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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