Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SCARF1Q14162 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SCARF1Q14162 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms