Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL3Q13618 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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