Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SKP2Q13309 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SKP2Q13309 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SKP2Q13309 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SKP2Q13309 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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