Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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