Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IFFO1Q0D2I5 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFFO1Q0D2I5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms