Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNB2Q08289 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms