Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms