Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CENPEQ02224 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CENPEQ02224 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms