Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC42EP1Q00587 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms