Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
RPS29P62273 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
RPS29P62273 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms