Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SMARCA2P51531 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMARCA2P51531 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms