Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM5CP41229 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms