Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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