Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ODC1P11926 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODC1P11926 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ODC1P11926 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms