Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTSVO60911 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTSVO60911 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTSVO60911 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTSVO60911 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTSVO60911 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTSVO60911 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CTSVO60911 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTSVO60911 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTSVO60911 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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