Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC8A2Q9UPR5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC8A2Q9UPR5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A2Q9UPR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms