Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
INO80Q9ULG1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
INO80Q9ULG1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
INO80Q9ULG1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
INO80Q9ULG1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms