Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Phf6Q9D4J7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Phf6Q9D4J7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Phf6Q9D4J7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms