Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mrpl55Q9CZ83 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl55Q9CZ83 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms