Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRFN3Q9BTN0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRFN3Q9BTN0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms