Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PPP1R9BQ96SB3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPP1R9BQ96SB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPP1R9BQ96SB3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms