Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD2Q96C19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD2Q96C19 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD2Q96C19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD2Q96C19 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD2Q96C19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFHD2Q96C19 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFHD2Q96C19 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms