Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGB2Q6NT52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGB2Q6NT52 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGB2Q6NT52 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms